Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Veri Analizi ve GörüntülemeBYM459135300
ÖnkoşullarYok
YarıyılGüz
Dersin Diliİngilizce
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüSeçmeli @ Biyomühendislik Lisans Programı
Ders KategorisiTemel Meslek Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimBiyomühendislik Bölümü
Dersin KoordinatörüAlper Yılmaz
Dersi Veren(ler)Sevil Yücel
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıGünümüzde, hızla gelişen teknoloji beraberinde karmaşık ve çok veri üretmektedir. Dersimizde gösterilen yazılımlar ile bu karmaşık verilerin kolaylıkla işlenmesi, analiz edilmesi ve görselleşmesi için gerekli olan bilgiler öğrenilecektir.
Dersin İçeriğiBiyolojik ve mühendislik verilerinin Linux ortamında incelenmesi ve işlenmesi, veritabanlarında depolanmasi ve sorgulanması, görselleştirme yardımıyla karmaşık verilerin anlamlandırılması.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Bessant C., Shadforth I., Oakley D., Building Bioinformatics Solutions: with Perl, R and MySQL, Oxford University Press, USA, 2009.
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Linux terminalini rahatça kullanır hale gelir
  2. Büyük ve karmaşik dosyaları kolayca işler hale gelir
  3. Perl programlama dili ile komut dosyası yazabilir hale gelir
  4. Veri depolama konusunda klasik ve modern uygulamaları öğrenir
  5. Basit ve kompleks görüntüleme tekniklerini ve uygulamalarını öğrenir

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Linux terminaline girişDers Kitabi1
2Veri işlemede kullanılan komutlar: cut, sort, uniq, join, grepDers Kitabi1
3Sed ile veri işlemeDers Kitabi1
4Awk ile veri işleme ve analiziDers Kitabi1
5Perl programlama diline girişDers Kitabi1
6Perl ve karmaşık veri yapılarıDers Kitabi1
7Veri depolama ve sorgulama : veritabanları (MySQL)Ders Kitabi1
8SQL tabanlı olmayan veri tabanları : NoSQLDers Kitabi1
9Ara sınavDers Kitabi1
10Gnuplot ile pratik veri görüntülemeDers Kitabi1
11R girişDers Kitabi1
12R plyr paketi ile veri işlemeDers Kitabi1
13R ggplot2 paketiDers Kitabi1
14İnteraktif görüntüleme : GephiDers Kitabi1
15Proje sunumlarıDers Kitabi1
16Final Ders Kitabi1

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev115
Sunum/Jüri110
Projeler115
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar120
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması143
Derse Özgü Staj
Ödev116
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler115
Sunum / Seminer15
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)115
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)115
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok