| Ders Adı | Kodu | Yerel Kredi | AKTS | Ders (saat/hafta) | Uygulama (saat/hafta) | Laboratuar (saat/hafta) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Genetik Mühendisliği | BYM3652 | 3 | 4 | 2 | 0 | 2 |
| Önkoşullar | Yok |
|---|
| Yarıyıl | Bahar |
|---|
| Dersin Dili | İngilizce, Türkçe |
|---|---|
| Dersin Seviyesi | Lisans |
| Dersin Türü | Zorunlu @ Biyomühendislik Lisans Programı (İngilizce) |
| Ders Kategorisi | Temel Meslek Dersleri |
| Dersin Veriliş Şekli | Yüz yüze |
| Dersi Sunan Akademik Birim | Biyomühendislik Bölümü |
|---|---|
| Dersin Koordinatörü | Dilek Balık |
| Dersi Veren(ler) | Sevil Yücel |
| Asistan(lar)ı | Ayşegül Erdemir, Emrah Sarıyer |
| Dersin Amacı | Bu ders öğrencilere prokaryotik ve ökaryotik sistemlerde rekombinant DNA yı klonlama ve ekspresyon vektörlerine aktarmak ve vektör tasarımı konularında temel bilgi vermek amacıyla teorik ve laboratuvar uygulamaları olarak organize edilmiştir. Bununla birlikte bu ders sırasında genetik mühendisliği uygulamalarının potansiyel gücü, tehlikeleri ve etiğini içeren birçok temel genetik mühendisliği uygulamaları sunulacaktır. Öğrencilere özellikle genomik, onkogenomik, proteomik, organizmaların klonlanması, insan genom projesi, genetiği değiştirilmiş organizmalar, gen terapisi ve genetik mühendisliğinde etik ile genetik mühendisliği üzerine bir proje tasarımı konularında detaylı bilgi verilecektir. Derslere paralel olarak laboratuvar uygulamaları yaptırılacaktır. |
|---|---|
| Dersin İçeriği | Genetik mühendisliği tanımı, tarihçesi ve temel ilkeleri. Genetik materyalin bakteri, virüs ve ökaryotik hücrelerden izolasyonu, Restriksiyon endonukleaz enzim kesimi, restriksiyon haritalarının yapımı, kesilen fragmentlerin bağlanması (DNA ligaz enzimleri) ve genetik mühendisliğinde kullanılan diğer enzimlerin özellikleri, Doğal ve yapay transformasyon teknikleri (elektroporasyon, protoplast transformasyonu, mikroenjeksiyon, mikroprojektil bombardıman),Genetik aktarım sonrası, oluşturulan rekombinant hücrelerin tanımlanması ve rekombinant klonların geliştirilmesi, Klon vektörlerinin özellikleri ve hibrit klon vektörlerinin dizaynı, Gen kütüphanelerinin oluşturulması ve saklanması, DNA sondaları. Rekombinant klonların tanımlanmasında fonksiyonel tamamlama testlerinin kullanımı, Kromozom üzerinde gezinti ve ektopik bağlama teknikleri ile gen lokasyonlarının belirlenmesi, Southern, Northern, Western ve dot-blot analizleri, DNA dizi analizleri (Sanger, Maxam-Gilbert yöntemi ve modifikasyonları), Polimeraz zincir reaksiyonu ve moleküler tanıda kullanımı, Protein mühendisliğinde kullanılan temel teknikler ve uygulamalar, Genetik mühendisliği tekniklerinin gıda, sağlık, çevre alanında ve bilimsel araştırmalarda kullanımı, Genetik yapısı değiştirilmiş organizmaların mal ve hizmet üretiminde kullanımında yararlar ve riskler. Genetik Mühendisliği'nde etik kavramlar. Rekombinant DNA tekniklerini kullanarak gen klonlaması uygulamaları. |
| Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar |
|
| Opsiyonel Program Bileşenleri | Yok |
Ders Öğrenim Çıktıları
- Rekombinant DNA teknolojisi ve uygulamalarının temel teorik prensiplerini anlayabilir.
- Restriksiyon, ligasyon, transformasyon ve rekombinant plazmid seçimi gibi rekombinant DNA işlemlerini içeren temel teknikleri kullanabilir.
- Genlerin izolasyonu karakterizasyonu ve ekspresyonu için, rekombinant DNA molekülü ve vektör dizaynı yapabilecek gerekli teorik ve pratik özellikleri kazanır.
- Her laboratuar uygulamasından sonra laboratuar raporu hazırlayabilir
- Genetik mühendisliğinin çeşitli alanlarda kullanımına ilişkin avantaj ve riskleri değerlendirebilir.
- Genetik mühendisliği içeren uygulamalarda bir çalışma dizayn edebilir ve sunabilir.
Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları
| Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
|---|---|---|
| 1 | Genetik Mühendisliğine Giriş/Laboratuar uygulamalarına Giriş | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 2 | Rekombinant DNA Teknolojisi- Gen Klonlama Giriş-Vektörler-Restriksiyon enzimleri/ Laboratuar Kuralları | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 3 | Rekombinant DNA Teknolojisi- Gen Klonlama - Klonlama basamakları-Dizileme iyon/ Laboratuardaki cihaz ve kimyasalların tanıtımı | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 4 | Polimeraz zincir reaksiyonu ve uygulama alanları/Plazmid DNA izolasyonu (Vektör ve hedef DNA) | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 5 | Genomik ve Proteomik/PCR uygulaması | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 6 | Onkogenomik/Kristal viyole jel hazırlanması, nükleik asit elektroforezi ve CV jelden DNA ekstraksiyonu | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 7 | Model Organizmalar /Hedef ve vektör DNA'nın kesimi | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 8 | İnsan Genom Projesi ve Biyoinformatik/CV gel elektroforezi ve jelden geri kazanım | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 9 | Ara sınav | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 10 | Genetik Kopyalama/EtBr jel elektroforezi-Konsantrasyon kontrolü | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 11 | Genetiği Değiştirilmiş Organizmalar/Ligasyon ve Transformasyon | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 12 | Gen Terapisi/Koloni PCR | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 13 | Genetik mühendisliğinin ilaç endüstrisindeki uygulamaları/Pozitif kontrolü için EtBr jel elektroforezi | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 14 | Etik ve genetik mühendisliği/Gen ekspresyon analizi | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 15 | Tasarlanan projelerin sunumu | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
| 16 | Final | Belirtilen ders kitaplarından ön hazırlık |
Değerlendirme Sistemi
| Etkinlikler | Sayı | Katkı Payı |
|---|---|---|
| Devam/Katılım | ||
| Laboratuar | 1 | 20 |
| Uygulama | ||
| Arazi Çalışması | ||
| Derse Özgü Staj | ||
| Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği | ||
| Ödev | ||
| Sunum/Jüri | ||
| Projeler | 1 | 10 |
| Seminer/Workshop | ||
| Ara Sınavlar | 1 | 30 |
| Final | 1 | 40 |
| Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı | ||
| Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı | ||
| TOPLAM | 100 | |
AKTS İşyükü Tablosu
| Etkinlikler | Sayı | Süresi (Saat) | Toplam İşyükü |
|---|---|---|---|
| Ders Saati | 14 | 2 | |
| Laboratuar | 14 | 2 | |
| Uygulama | |||
| Arazi Çalışması | |||
| Sınıf Dışı Ders Çalışması | |||
| Derse Özgü Staj | |||
| Ödev | |||
| Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği | |||
| Projeler | 1 | 25 | |
| Sunum / Seminer | |||
| Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi) | 1 | 20 | |
| Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi) | 1 | 20 | |
| Toplam İşyükü : | |||
| Toplam İşyükü / 30(s) : | |||
| AKTS Kredisi : | |||
| Diğer Notlar | Yok |
|---|
