| Ders Adı | Kodu | Yerel Kredi | AKTS | Ders (saat/hafta) | Uygulama (saat/hafta) | Laboratuar (saat/hafta) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| İşlevsel Genomik | MBG5110 | 3 | 7.5 | 3 | 0 | 0 |
| Önkoşullar | Yok |
|---|
| Yarıyıl | Bahar |
|---|
| Dersin Dili | Türkçe |
|---|---|
| Dersin Seviyesi | Yüksek Lisans |
| Dersin Türü | Seçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans Programı |
| Ders Kategorisi | Uzmanlık/Alan Dersleri |
| Dersin Veriliş Şekli | Yüz yüze |
| Dersi Sunan Akademik Birim | Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü |
|---|---|
| Dersin Koordinatörü | Şenay Vural Korkut |
| Dersi Veren(ler) | İsmail Kocaçalışkan |
| Asistan(lar)ı |
| Dersin Amacı | Dersin amacı öğrencilere İşlevsel Genomik Araştırmalardaki güncel konularla tanışmalarını sağlamaktır. Çeşitli araştırma yöntemlerini ve uygulamalarının gösterilmesi de hedeflenmektedir./ |
|---|---|
| Dersin İçeriği | Fonksiyonel Genomiğin Tanımı, Kullanılan Yöntemler, Gen anlatımındaki Değişimlerin Gen Düzeyinde Belirlenmesi, Total RNA ve mRNA izolasyonları, Çıkarımlı cDNA Kütüphanelerinin Kurulması ve taranması, Gen Anlatımındaki değişimlerin Farklı Gösterim Tekniği ile analizi, Baskılayıcı Çıkarım Hibridizasyon Yöntemi, Mikroarray Kullanılarak Gen Anlatım analizi, Gen Ekspresyonunun Seri Analizi (SADE), Gen anlatımındaki Değişimlerin Protein Düzeyinde Belirlenmesi Proteomik Yöntemler, İki Boyutlu Jel Elektroforeziyle Protein analizi, Protein karakterizasyon yöntemleri, Gen Anlatım Analizinde Kullanılan Biyoinformatik Yöntemler, Nükleik Asit ve Protein Analizleri İçin İnternet Kaynakları, Nükleik Asit ve Protein Benzerlik Analizleri, Protein Yapı Modellemesi |
| Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar |
|
| Opsiyonel Program Bileşenleri | Yok |
Ders Öğrenim Çıktıları
- Bu dersin sonunda öğrenciler gen ve protein anlatım analizleri için mevcut olan güncel işlevsel genomik yöntemleri öğrenirler.
- Öğrenciler işlevsel genomik çalışmalar sonucu elde edilen verileri değerlendirmeyi öğrenir.
- Öğrenciler bu yaklaşımların kendi araştırmalarında uygulanabilirliğini değerlendirebilirler.
Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları
| Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
|---|---|---|
| 1 | Fonksiyonel Genomiğe Giriş ve Fonksiyonel Genomik Araştırmalarda Kullanılan Temel Yöntemler | Kaynak 1Bölüm1 |
| 2 | Total RNA ve mRNA izolasyonları ve Analizi | Kaynak 1Bölüm1 |
| 3 | Gen Kütüphanelerinin Oluşturulması ve İşlevsel GenomikAraştırmalarda Kullanımı | Kaynak 2Bölüm6 |
| 4 | Çıkarımlı cDNA Kütüphanelerinin Kurulması ve Taranması | Kaynak 1Bölüm2 |
| 5 | Gen Anlatımındaki değişimlerin Farklı Gösterim Tekniği ile Analizi | Kaynak 1Bölüm3 |
| 6 | Baskılayıcı Çıkarım Hibridizasyon Yöntemi | Kaynak 1Bölüm5 |
| 7 | Gen Ekspresyonunun Seri Analizi (SADE) | Kaynak 1Bölüm7 |
| 8 | Ara sınav | |
| 9 | Mikroarray Kullanılarak Gen Anlatım analizi | Kaynak 1Bölüm6 |
| 10 | Mikroarray Veri Analiz Yöntemleri | Kaynak 1Bölüm6 |
| 11 | Proteomikte Kullanılan Protein analiz Yöntemleri | Kaynak 1Bölüm10 |
| 12 | İki Boyutlu Jel Elektroforezi | Kaynak 1Bölüm9 |
| 13 | Kütle Spektrometresiyle Protein Karakterizasyonu | Kaynak 1Bölüm10 |
| 14 | Biyoinformatik: DNA ve Protein Benzerlik Analizleri | Kaynak 2 Bölüm9 |
| 15 | Protein Yapı Modellemesi | Kaynak 2 Bölüm9 |
| 16 | Final sınavı |
Değerlendirme Sistemi
| Etkinlikler | Sayı | Katkı Payı |
|---|---|---|
| Devam/Katılım | ||
| Laboratuar | ||
| Uygulama | ||
| Arazi Çalışması | ||
| Derse Özgü Staj | ||
| Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği | ||
| Ödev | 2 | 20 |
| Sunum/Jüri | 1 | 10 |
| Projeler | ||
| Seminer/Workshop | ||
| Ara Sınavlar | 1 | 30 |
| Final | 1 | 40 |
| Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı | ||
| Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı | ||
| TOPLAM | 100 | |
AKTS İşyükü Tablosu
| Etkinlikler | Sayı | Süresi (Saat) | Toplam İşyükü |
|---|---|---|---|
| Ders Saati | 14 | 3 | |
| Laboratuar | |||
| Uygulama | |||
| Arazi Çalışması | |||
| Sınıf Dışı Ders Çalışması | 14 | 6 | |
| Derse Özgü Staj | |||
| Ödev | 2 | 10 | |
| Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği | |||
| Projeler | |||
| Sunum / Seminer | 1 | 8 | |
| Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi) | 1 | 30 | |
| Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi) | 1 | 40 | |
| Toplam İşyükü : | |||
| Toplam İşyükü / 30(s) : | |||
| AKTS Kredisi : | |||
| Diğer Notlar | Yok |
|---|
