| Ders Adı | Kodu | Yerel Kredi | AKTS | Ders (saat/hafta) | Uygulama (saat/hafta) | Laboratuar (saat/hafta) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Proteomik | MBG6119 | 3 | 7.5 | 3 | 0 | 0 |
| Önkoşullar | Yok |
|---|
| Yarıyıl | Güz |
|---|
| Dersin Dili | Türkçe |
|---|---|
| Dersin Seviyesi | Doktora |
| Dersin Türü | Seçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora Programı |
| Ders Kategorisi | Uzmanlık/Alan Dersleri |
| Dersin Veriliş Şekli | Yüz yüze |
| Dersi Sunan Akademik Birim | Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü |
|---|---|
| Dersin Koordinatörü | Emel Ordu |
| Dersi Veren(ler) | İsmail Kocaçalışkan |
| Asistan(lar)ı |
| Dersin Amacı | Bu ders ile proteom ve proteomik kavramının çeşitli model organizmalar üzerinde karşılaştırmalı olarak öğrenilmesi; temel proteomik yöntemlerinin ve analiz yollarının örnek literatürler üzerinden tartışılması; tıp, ilaç, kozmetik, gıda ve benzeri biyoteknolojik uygulama alanlarında kullanımının kavranması amaçlanmaktadır. |
|---|---|
| Dersin İçeriği | Proteomik dersi; proteom ve proteomik kavramlarına ve araştırmalara genel bakış, protein analizinde iki yönlü elektroforez (2-D), proteinlerin enzimatik parçalanması ve peptidlerin HPLC ile ayrılması, peptid ve proteinlerin dizi analizleri, proteom analizlerinde, kütle spektrometresi, biyoinformatik, Protein ekspresyon profilinin belirlenmesi, proteomik analizlerde model sistemler, proteomikte son gelişmeler ve uygulama alanlarını içermektedir. |
| Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar |
|
| Opsiyonel Program Bileşenleri | Yok |
Ders Öğrenim Çıktıları
- Dersin sonunda öğrenciler proteom ve proteomik kavramlarını öğreneceklerdir.
- Öğrenciler birçok organizmanın farklı proteom çalışmaları hakkında bilgi sahibi olacaklardır.
- Öğrenciler proteinlerin yapı analizlerinde en son gelişmelerde kullanılan yöntemleri sorgulayabileceklerdir.
- Öğrenciler proteomik çalışmalarının biyoteknoloji ve farklı alanlardaki uygulamalarını öğreneceklerdir.
Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları
| Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
|---|---|---|
| 1 | Proteom ve Proteomik kavramlarına giriş, ökaryotik ve prokaryotik proteom | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 2 | Analitik proteomike genel bakış | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 3 | Analitik peptid ve protein saflaştırılması | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 4 | Proteomikte deneysel stratejilere giriş, jel bazlı ayırıcı, protein/peptidlerin jelde görüntülenmesi, proteomik uygulamalarda çipler | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 5 | Peptid ve protein analizleri için kütle spektrometresi | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 6 | “ Peptide Mass Fingerprinting” ile Protein tanımlanması | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 7 | Tandem kütle spektrometre ile dizi analisi ve protein tanımlanması | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 8 | Ara Sınav | |
| 9 | SALSA: Tandem MS bilgisinin spesifik özellikleri için bir algoritma | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 10 | Proteomların incelenmesi, protein ekspresyon profilinin belirlenmesi | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 11 | Protein protein etkileşimlerinin ve protein komplekslerinin tanımlanması | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 12 | Proteom modifikasyonlarının haritalanması | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 13 | Proteomikte son gelişmeler, tıp alanında uygulamaları | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 14 | Proteomikte son gelişmeler, ilaç sektöründe uygulamaları | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 15 | Proteomikte son gelişmeler, biyoteknolojide uygulamaları | Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri |
| 16 | Final SInavı |
Değerlendirme Sistemi
| Etkinlikler | Sayı | Katkı Payı |
|---|---|---|
| Devam/Katılım | ||
| Laboratuar | ||
| Uygulama | ||
| Arazi Çalışması | ||
| Derse Özgü Staj | ||
| Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği | ||
| Ödev | 1 | 10 |
| Sunum/Jüri | 2 | 20 |
| Projeler | 1 | 10 |
| Seminer/Workshop | ||
| Ara Sınavlar | 1 | 20 |
| Final | 1 | 40 |
| Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı | ||
| Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı | ||
| TOPLAM | 100 | |
AKTS İşyükü Tablosu
| Etkinlikler | Sayı | Süresi (Saat) | Toplam İşyükü |
|---|---|---|---|
| Ders Saati | 14 | 3 | |
| Laboratuar | |||
| Uygulama | |||
| Arazi Çalışması | |||
| Sınıf Dışı Ders Çalışması | 14 | 4 | |
| Derse Özgü Staj | |||
| Ödev | 1 | 20 | |
| Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği | |||
| Projeler | 1 | 20 | |
| Sunum / Seminer | 2 | 20 | |
| Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi) | 1 | 20 | |
| Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi) | 1 | 20 | |
| Toplam İşyükü : | |||
| Toplam İşyükü / 30(s) : | |||
| AKTS Kredisi : | |||
| Diğer Notlar | Yok |
|---|
